本会的前身是「  三水公司」，三水公司到底创立於什么年代，因缺乏考证资料，已无法确定，但根据三水公司总坟之立碑年代，即清光绪十一年（  亦即公元 1885 年），可以肯定三水公司之创立，应该早於 1885 年，因为，根据正常推理，应先有组织，后有总坟。无论如何，即使以 1885 年作为三水公司之创立年份，本会至今也有 123 年的历史了。

 当时之三水公司，据悉并无一固定之会所，乃由一名炉主、二名协理，每年召集同乡到总坟前，举行春秋祭祀，入晚，举行联欢宴会。第二次世界大战前，一班同乡先贤，鉴於我同乡无一固定之所，可供聚集共叙乡谊之用，遂倡议筹组会馆，无奈，筹组会馆一事尚未展开，大战爆发，日军南侵，马来亚失守，槟岛被炸，前三水公司所存於新街志成钟表店，钱永昌同乡处之一切文件，全被焚毁，筹组会馆一事，因而搁下，而前三水公司早期史实，也因此无从查考矣。

 虽然前三水公司早期史实，无从查考，但根据历史考证家郑永美先生所提供的资料佐证，本会於三水公司期间，出了一位声名赫赫的书法家，他就是先贤黎健行乡亲。黎乡亲不但是一位书法家，同时也是一位成功的殷商，其墨宝极受当时华社的欢迎，本屿多间华社及商号的匾额，皆出自其手；其业务遍布北马各州。黎乡亲曾担任当年平章会馆的协理等职，他也是当年三水公司派往广东暨汀州会馆的代表，自 1906 年到 1933 年，分别担任总理、司理、办祭员等职。

 光复后，于 1946 年，何琚英、邓善培、邓彭生等乡亲重提复组会馆一事，当时获得邓渭槎、董康华、何宝亨、卢植生、周炳泉、李伟祯等同乡响应及大力支持、并於翌年四月春祭联欢宴会上，即席产生筹委会职员，进行物色会址，起草章程、办理注册手续。后租得日本横街门牌 114 号前厅，作为临时会所，同年 8 月 31 日秋祭联欢宴会席上，筹委会主席何琚英乡亲宣布三水公司正式复会，易名为「  槟城三水会馆」，并推选首届理事会职员，何琚英乡亲当选首届主席。

 翌年即 1948 年，众同乡咸认为临时会所不敷应用，遂於该年六月间迁往爱情巷 43 号，并藉乔迁之喜，庆祝复会一周年纪念。庆典上，主席何琚英乡亲揭采大门横额「  三水会馆」 四大金字。此四大金字，为当时理事董康华乡亲之墨迹。

 1949 年初，职员会议决通过重修「  三水公司总坟」，并易名为「  三水总坟」，耗资五百余元，悉数由会员捐助。同年 4 月 10 日举行祭祀新总坟仪式。

 自此，槟城三水会馆即如一般乡团，推动例常的乡会活动，如春秋二祭，周年纪念，颁发会员子女奖励金，同时，极尽联络乡亲之责，为会员乡亲们谋求福利，数拾年如一日，这全归功予历届职员会诸理事任劳任怨之精神。好景不常， 2000 年 1 月 1 日 1948 年屋租统制法令终于被撤消，本会被逼搬离租赁已达 53 年的会所而开始过着流离失所的日子，直至 2003 年初，本会在众志成城的精神之下，筹得一笔款项，更获得槟榔屿广东暨汀州会馆资助二万元，始购得位於兽医路门牌  1－1－9  一单位充当会所，本会终于有了属於自身的固定会所，并於 26－6－2004 举行开幕仪式，三水会馆四大金字匾额终于再度悬挂起来。

	槟城三水会馆新会所开幕暨庆祝成立119周年纪念联欢宴会热烈场面。
	槟城三水会馆26－6－2004新会所开幕，设茶会招待出席观礼嘉宾。
	槟城三水会馆新会所开幕暨庆祝成立119周年纪念联欢宴会敬酒场面。